Refere-se ao tipo de informação dentro do par de alelos que expressa um traço. Utilizamos letras para descrever essa informação: letras maiúsculas representam características dominantes, letras minúsculas representam características recessivas. Usando esse sistema, podemos prever a probabilidade de traços e como eles podem ser transmitidos à prole.

Isso pode parecer técnico, mas faz sentido quando usamos os quadros de Punnett para prever descendência e herança.

De forma simples, genotipagem é usar 1–2 letras para expressar o que o alelo está fazendo (se é dominante, recessivo, Heterozigoto ou Homozigoto). Isso não descreve como será o fenótipo. Ele deve primeiro ser observado.

Exemplo: Sabemos que um filhote pode herdar características de dois ou três traços diferentes, mas não podemos prever sua aparência exata até que esse morph seja produzido e o fenótipo observado.